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La Unidad de Auditoría Interna proporciona apoyo para el mejoramiento y agregado de valor a la gestión de procesos y el control interno de la UNL. Consisten en realizar informes, análisis y evaluaciones de las actividades universitarias, empleando el enfoque de Control Integral e Integrado, de manera de asegurar la continua optimización de los niveles de eficiencia, economía y eficacia de la gestión de la UNL.
Así, desde la UAI se apunta a agregar valor a la gestión elaborando el planeamiento general de Auditoría Interna de acuerdo con las Normas Generales de Control Interno y de Auditoría Interna; verificando el cumplimiento de las políticas, planes, y procedimientos establecidos por la autoridad superior y evaluando la aplicación de los controles operativos, contables, de legalidad y financieros; realizando observaciones y formulando recomendaciones a los fines de añadir valor a las acciones desarrolladas y efectuando su seguimiento; e incentivando al involucramiento del personal a través de su formación y desarrollo continuo de habilidades y competencias, para lograr la mejora continua en el desempeño de sus funciones.
La UAI realiza planificaciones de tres niveles; estratégica o plan de ciclo, anual e individual para cada auditoría. Para tratar los temas propios del sistema de control la UNL cumple con la convocatoria a reuniones del Comité de Control.