El Rector es el representante de la Universidad y dirige todas las actividades de la misma. Es elegido por la Asamblea Universitaria, junto al/la Vicerrector/a, y tiene un mandato de 4 años, pudiendo ser reelecto una sola vez en forma consecutiva.
El 10 de diciembre de 2021, en Asamblea Universitaria fue reelegido Enrique Mammarella como Rector acompañado por Larisa Carrera como Vicerrectora para el período 2022 – 2026
Res. AU N.º 4 – Designación Rector y Vicerrectora 2022 – 2026